Opracowana na bazie seryjnego Pajero wersja Flex poddana została szeregowi modyfikacji. Zmiany objęły materiały wykorzystane do produkcji, silnik oraz system paliwowy, co pozwoliło przystosować samochód do pracy na dowolnej mieszance benzyny i bioetanolu (alkohol pochodzenia roślinnego).

2-litrowy, 16-zaworowy silnik, który napędza Pajero TR4 Flex, po zatankowaniu 100 proc. benzyny rozwija moc 133 KM, a jego maksymalny moment obrotowy wynosi 177 Nm. Jeśli jednostka pracuje na czystym alkoholu, moc pozostaje bez zmian, a maksymalny moment obrotowy wzrasta do 186 Nm.

Obecnie koncern MMC forsuje technologię FFV jako odpowiedź na światowe trendy promujące paliwa alternatywne. Trwają również prace nad modelem z systemem Flexible Fuel, który pojawi się w sprzedaży w Ameryce Północnej w roku budżetowym 2009.