Ministerstwo Finansów ustosunkowało się do interpelacji poselskiej nr 16702, dotyczącej opodatkowania świadczeń medycznych dla pracowników po uchwale NSA z 24 maja 2010 r. (sygn. akt II FPS 1/10).

Jak wskazano w powołanej interpelacji, urzędy skarbowe upominają się o podatek od pakietów medycznych opłacanych pracownikom przez firmy, przy czym chodzi o zaległości z ostatnich 5 lat. W związku z niejasnymi przepisami wspomniani pracownicy dotychczas nie płacili z tego tytułu podatku dochodowego PIT. Dopiero ostatnio Naczelny Sąd Administracyjny potwierdził, że od abonamentu trzeba płacić podatek. Oznacza to, że osoby, którym pracodawca zafundował abonament, np. za 40 zł miesięcznie, nie płacąc od niego podatku np. przez 5 lat, będą musiały odprowadzić go od kwoty ok. 2.400 zł. W zależności od stawek podatkowych może to być 500-900 zł, plus odsetki za zwłokę.

Dlatego skierowano do Ministra Finansów pytania, czy prawdą jest, że urzędy skarbowe żądają zapłaty podatku od pakietów medycznych opłacanych pracownikom przez firmy oraz na jakiej podstawie mogą zażądać zapłaty tego podatku.

Ministerstwo Finansów, powoławszy się m.in. na treść art. 11 ust. 1, art. 12 ust. 1 i 3 oraz art. 31 updof podkreśliło m.in., że stanowisko resortu, jak i organów podatkowych było powszechnie znane za sprawą mediów, które w ostatnich latach szeroko komentowały tę sprawę. Jeżeli płatnicy mieli wątpliwości co do obowiązku pobierania zaliczek na podatek od przedmiotowych świadczeń, mogli występować z wnioskiem o wydanie indywidualnej interpretacji przepisów prawa podatkowego. Biorąc powyższe pod uwagę, należy stwierdzić, że płatnicy, którzy mimo wątpliwości co do tego, czy powinni pobierać zaliczki na podatek, czy też nie powinni pobierać zaliczek od świadczeń w postaci abonamentów medycznych, nie wystąpili o interpretację indywidualną i zdecydowali się nie pobierać zaliczek od tych świadczeń, ponieśli ryzyko, którego wielkość musieli oszacować. Według MF, treść uchwały 7 sędziów NSA z dnia 24 maja 2010 r. przekonuje, że ryzyko to się nie opłaciło. Dlatego też niezbędne będzie poniesienie przewidzianych prawem konsekwencji.